MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 29677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013741	TTC	2	6	158552	158557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161306
3002	NC_013741	TCA	2	6	158590	158595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161306
3003	NC_013741	AGA	2	6	158621	158626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284161307
3004	NC_013741	TAT	2	6	158662	158667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284161307
3005	NC_013741	CGG	2	6	158670	158675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284161307
3006	NC_013741	TC	3	6	158718	158723	0 %	50 %	0 %	50 %	284161307
3007	NC_013741	CA	3	6	158761	158766	50 %	0 %	0 %	50 %	284161307
3008	NC_013741	CCA	2	6	158807	158812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284161307
3009	NC_013741	TTC	2	6	158843	158848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161307
3010	NC_013741	CAA	2	6	158886	158891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284161307
3011	NC_013741	TTG	2	6	158913	158918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161307
3012	NC_013741	ACA	2	6	158930	158935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284161307
3013	NC_013741	CT	3	6	159055	159060	0 %	50 %	0 %	50 %	284161307
3014	NC_013741	TC	3	6	159089	159094	0 %	50 %	0 %	50 %	284161307
3015	NC_013741	TCAA	2	8	159161	159168	50 %	25 %	0 %	25 %	284161307
3016	NC_013741	ATC	2	6	159169	159174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161307
3017	NC_013741	TCT	2	6	159183	159188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161307
3018	NC_013741	AC	3	6	159261	159266	50 %	0 %	0 %	50 %	284161308
3019	NC_013741	TAT	2	6	159308	159313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284161308
3020	NC_013741	GTC	2	6	159357	159362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284161308
3021	NC_013741	TCT	2	6	159379	159384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161308
3022	NC_013741	CT	3	6	159386	159391	0 %	50 %	0 %	50 %	284161308
3023	NC_013741	TTGC	2	8	159496	159503	0 %	50 %	25 %	25 %	284161308
3024	NC_013741	CTC	2	6	159504	159509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161308
3025	NC_013741	TA	3	6	159676	159681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_013741	TA	4	8	159683	159690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_013741	TGA	2	6	159709	159714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284161309
3028	NC_013741	GGA	2	6	159743	159748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161309
3029	NC_013741	AGG	2	6	159850	159855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161309
3030	NC_013741	GAA	2	6	159884	159889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284161309
3031	NC_013741	TCA	2	6	159924	159929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161309
3032	NC_013741	CCTG	2	8	159943	159950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_013741	TCA	2	6	159953	159958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_013741	TAA	2	6	159983	159988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013741	TTG	2	6	160085	160090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161310
3036	NC_013741	TTA	2	6	160187	160192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284161310
3037	NC_013741	CTT	2	6	160277	160282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161310
3038	NC_013741	TCA	2	6	160364	160369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161310
3039	NC_013741	TA	3	6	160489	160494	50 %	50 %	0 %	0 %	284161310
3040	NC_013741	TAC	2	6	160497	160502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161310
3041	NC_013741	TCA	2	6	160517	160522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161310
3042	NC_013741	TCC	2	6	160599	160604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161310
3043	NC_013741	TAT	2	6	160614	160619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284161310
3044	NC_013741	T	6	6	160667	160672	0 %	100 %	0 %	0 %	284161310
3045	NC_013741	TCT	2	6	160731	160736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161310
3046	NC_013741	CT	3	6	160735	160740	0 %	50 %	0 %	50 %	284161310
3047	NC_013741	CTT	2	6	160899	160904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161310
3048	NC_013741	TTG	2	6	161005	161010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161310
3049	NC_013741	ATA	2	6	161085	161090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013741	A	6	6	161090	161095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013741	CAGC	2	8	161118	161125	25 %	0 %	25 %	50 %	284161311
3052	NC_013741	GTC	2	6	161131	161136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284161311
3053	NC_013741	TCTT	2	8	161148	161155	0 %	75 %	0 %	25 %	284161311
3054	NC_013741	CTT	2	6	161182	161187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161311
3055	NC_013741	TCC	2	6	161207	161212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161311
3056	NC_013741	CT	3	6	161218	161223	0 %	50 %	0 %	50 %	284161311
3057	NC_013741	CT	4	8	161250	161257	0 %	50 %	0 %	50 %	284161311
3058	NC_013741	CAC	2	6	161314	161319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_013741	TA	3	6	161347	161352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013741	TGG	2	6	161386	161391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013741	ATA	2	6	161442	161447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013741	TA	3	6	161451	161456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_013741	CTTG	2	8	161482	161489	0 %	50 %	25 %	25 %	284161312
3064	NC_013741	TA	3	6	161514	161519	50 %	50 %	0 %	0 %	284161312
3065	NC_013741	CAC	2	6	161563	161568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284161312
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3067	NC_013741	TCC	2	6	161660	161665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161312
3068	NC_013741	TCC	2	6	161708	161713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161312
3069	NC_013741	CTT	2	6	161795	161800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161312
3070	NC_013741	TGG	2	6	161808	161813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284161312
3071	NC_013741	CT	3	6	161936	161941	0 %	50 %	0 %	50 %	284161312
3072	NC_013741	CTC	2	6	161957	161962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161312
3073	NC_013741	TGT	2	6	161972	161977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161312
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3076	NC_013741	TC	3	6	162156	162161	0 %	50 %	0 %	50 %	284161312
3077	NC_013741	CAAT	2	8	162214	162221	50 %	25 %	0 %	25 %	284161312
3078	NC_013741	CAG	2	6	162235	162240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284161312
3079	NC_013741	TGT	2	6	162265	162270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161312
3080	NC_013741	TCA	2	6	162321	162326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_013741	TCA	2	6	162347	162352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_013741	AGA	2	6	162449	162454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013741	AAATTT	2	12	162482	162493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_013741	GAG	2	6	162534	162539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161313
3085	NC_013741	TAA	2	6	162721	162726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284161313
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3088	NC_013741	TAA	2	6	162901	162906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284161313
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3090	NC_013741	AG	3	6	162978	162983	50 %	0 %	50 %	0 %	284161313
3091	NC_013741	TACC	2	8	163057	163064	25 %	25 %	0 %	50 %	284161313
3092	NC_013741	TTC	2	6	163077	163082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161313
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3095	NC_013741	CTT	2	6	163334	163339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161313
3096	NC_013741	AC	3	6	163342	163347	50 %	0 %	0 %	50 %	284161313
3097	NC_013741	ATT	2	6	163424	163429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284161313
3098	NC_013741	AAC	2	6	163445	163450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284161313
3099	NC_013741	ACG	2	6	163482	163487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284161313
3100	NC_013741	TA	3	6	163488	163493	50 %	50 %	0 %	0 %	284161313
3101	NC_013741	GAG	2	6	163512	163517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161313
3102	NC_013741	GTT	2	6	163545	163550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161313
3103	NC_013741	CGT	2	6	163606	163611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284161313
3104	NC_013741	GTT	2	6	163635	163640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161313
3105	NC_013741	TTC	2	6	163707	163712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161313
3106	NC_013741	TTG	2	6	163792	163797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284161313
3107	NC_013741	GCT	2	6	163823	163828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284161313
3108	NC_013741	CTGG	2	8	163836	163843	0 %	25 %	50 %	25 %	284161313
3109	NC_013741	TAATT	2	10	163879	163888	40 %	60 %	0 %	0 %	284161313
3110	NC_013741	CTT	2	6	163927	163932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161314
3111	NC_013741	CA	3	6	163965	163970	50 %	0 %	0 %	50 %	284161314
3112	NC_013741	TAT	2	6	164001	164006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284161314
3113	NC_013741	CT	3	6	164100	164105	0 %	50 %	0 %	50 %	284161314
3114	NC_013741	TTC	2	6	164119	164124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161314
3115	NC_013741	GTC	2	6	164156	164161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284161314
3116	NC_013741	CTT	2	6	164191	164196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284161314
3117	NC_013741	ATC	2	6	164204	164209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161314
3118	NC_013741	TCA	2	6	164285	164290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284161314
3119	NC_013741	TG	3	6	164295	164300	0 %	50 %	50 %	0 %	284161314
3120	NC_013741	CCT	2	6	164448	164453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161314
3121	NC_013741	CTG	2	6	164556	164561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284161314
3122	NC_013741	CT	3	6	164581	164586	0 %	50 %	0 %	50 %	284161314
3123	NC_013741	T	7	7	164608	164614	0 %	100 %	0 %	0 %	284161314
3124	NC_013741	TTAAAA	2	12	164644	164655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013741	AAG	2	6	164687	164692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284161315
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3242	NC_013741	T	6	6	171831	171836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_013741	T	6	6	171971	171976	0 %	100 %	0 %	0 %	284161324
3244	NC_013741	TCC	2	6	172025	172030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161324
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3487	NC_013741	CTC	2	6	185832	185837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284161341
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3489	NC_013741	TA	3	6	185949	185954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_013741	TGG	2	6	186008	186013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_013741	TGA	2	6	186068	186073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3494	NC_013741	TTG	2	6	186233	186238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_013741	AGG	2	6	186418	186423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161342
3497	NC_013741	GATA	2	8	186447	186454	50 %	25 %	25 %	0 %	284161342
3498	NC_013741	GGA	2	6	186511	186516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161342
3499	NC_013741	GAG	2	6	186685	186690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284161342
3500	NC_013741	GA	3	6	186730	186735	50 %	0 %	50 %	0 %	284161342

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